厦门市口腔医院是厦门市唯一的一家口腔专科医院，三级达标医院。医疗设备先进，技术力量雄厚。全院拥有进口口腔综合治疗机100余台，职工总人数180余人人，其中研究生以上学历22人，本科以上学历约占70%，副主任医师以上职称26，硕士研究生导师3人，厦门市医学学术带头人2人，有2个厦门市重点学科。担负着福建医科大学研究生、本科生及厦门医学高等专科学校的临床教学任务。

医院严格按照卫生部三级专科医院设置标准，设有4个一级科室，包括口腔内科，口腔外科，口腔修复科，口腔正畸科。在此基础上，口腔内科又分为牙体牙髓、牙周病、黏膜病、儿童口腔预防保健科四个二级分科;口腔修复科分为口腔活动义齿、口腔固定义齿、义齿技工中心三个二级分科;口腔外科分为口腔外科门诊、口腔颌面外科病房、手术室、口腔种植中心四个二级分科。设急诊科、放射科、检验科、消毒配送中心、病理科等辅助科室及用于科研的口腔医学研究所。

医院严格遵守卫生部《临床技术操作规范》，临床上规范诊疗规范操作，并与国内外先进技术接轨，引进并应用了一系列先进的口腔治疗仪器、技术和方法。如：丹麦产根管测量仪、镍钛根管扩大系统、烤瓷机、意大利产高频离心铸造机、点焊机、德国平衡研磨仪、口腔内窥镜、法国产全景X光头颅测量仪、RV机、CCD数学摄像网络等精密仪器。如镍钛根管治疗技术，根尖手术，根管长度测量仪，口腔内窥镜，牙周病诱导再生治疗术，根管刮治术，口腔黏膜癌前病变早期治疗，烤瓷体修复，磁性附着体镶牙技术，隐形义齿修复，口腔种植技术，牙体再植及牙体移植术，口腔颌面外伤，口腔颌面肿瘤切除术，儿童牙病无痛性治疗，儿童牙病预防，儿童、青少年、成人方丝弓、直丝弓矫治术[以纠正牙列不齐、牙列拥挤、反牙合( 地包天)、深覆牙合深覆盖(暴牙)等，改善患者面形，给患者一副整齐、健康、美丽的牙齿]。同时，医院拥有自己的义齿制作中心，承担着院内外各种烤瓷牙等固定及各种可摘义齿的制作和加工。医院引进两条意大利手机消毒线，严格按照卫生部有关《口腔器械消毒技术操作规范》，做到一人一机，一物一用一消毒(灭菌)，杜绝交叉感染。

近年来有22项科研立项，其中9项科研成果获得省、市科技进步奖。出版6本专著，拥有3位中华口腔专业委员会委员。医院先后举办了“世界牙科联盟会议”、“国际色彩学研讨会”、“全国粘膜病学术研讨会”、“闽台口腔医学学术研讨会”、“全国口腔工艺规范教材编写会”等大型全国性学术会议。5年来有200多篇文章刊登在口腔医学杂志上。2002年成立了厦门市口腔医学研究所，将医疗、教学、科研与先进的技术有机结合起来，提高了厦门地区口腔医学的医、教、研水平，加大了医院与全国高校的横向联系及同国内外医学院、科研院所在医、教、，研等方面进行高水平的合作与交流。