医院科室齐全，实力雄厚。医院有临床、医技科室60个，设有台胞医疗服务中心和健康体检中心。其中，神经内科、整形外科、普通外科为国家临床重点专科建设项目单位，中西医结合心血管科为国家中医药管理局重点专科及福建省中医、中西医结合重点专科；神经内科、骨科、神经外科为福建省临床重点专科建设项目；神经内科、耳鼻咽喉科为福建省医学重点学科；高血压、骨科专业为福建省医学领先特色专业；神经病学、高血压、腹部外科、耳鼻咽喉科、眼科专业被福建省科技厅定为优先发展学科。福建省神经病学研究所、福建省高血压研究所、福建省腹部外科研究所、福建省骨科研究所、福建省眼科研究所、福建省耳鼻咽喉研究所、福建省皮肤病性病防治研究所等7个省级研究所，福建省医学会15个专科分会、福建省中西医结合学会等11个省级医学专科分会，福建省麻醉质控中心、福建省危重病监护质控中心和福建医科大学17个研究室，5个福建医科大学临床医学重点学科挂靠我院；医院是国家药物临床试验机构、国家卫生计生委临床药师培训基地、国家卫生计生委临床药师师资培训基地、国家卫生计生委肝移植定点机构、国家卫生计生委化妆品不良反应鉴定机构、国家卫生计生委脑卒中筛查与防治基地、国家卫生计生委冠心病介入诊疗培训基地、国家卫生计生委内镜与微创医学骨科培训基地、国家卫生计生委内镜与微创医学耳鼻咽喉科培训基地、国家卫生计生委内镜与微创医学神经外科培训基地、国家卫生计生委外周血管介入诊疗培训基地、国家卫生计生委内镜与微创医学妇产科培训基地、国家卫生计生委内镜与微创医学泌尿外科培训基地、国家卫生计生委内镜与微创医学普外科培训基地；设有福建省华侨医疗服务中心、福建省儿童弱视斜视防治中心、福建省新生儿听力筛查诊断中心、福建省慢病（高血压）防治中心、福建省老年眼病视觉工程技术研究中心、福建省睡眠呼吸疾病诊疗中心，同时是首批省、市各类医疗保险和省司法厅亲权鉴定（亲子鉴定）的定点单位。医院承担国家级刊物——《中华高血压杂志》的编辑和出版工作。

       医院拥有PET/CT、复合线路SPECT、640层螺旋CT、3.0T超导MRI、数字减影心血管造影装置（DSA）、多功能全数字化X光机、3D C臂移动X光机、高中能直线加速器、三维适形调强放射治疗系统、双能X线全身骨密度分析仪、体外震波碎石机、连续性肾脏替代治疗仪、准分子激光器、眼底及脉络膜荧光造影机、光学相干断层摄影仪（OCT）、各种高端听（视）觉检查设备、全自动细菌检测培养仪及高档生化仪、免疫分析仪流水装置系统、各种系列内窥镜、电子镜，彩色多普勒超声诊断仪、体外循环机、麻醉工作站、手术定位导航系统、超声刀、癫痫刀、神经电生理监测系统、第三代气压弹道超声碎石仪、生物波脱敏治疗仪、手术显微镜、超声胃镜、支气管镜等先进的仪器设备；拥有31间现代化的层流净化并配有数字一体化的手术室，带有层流净化、正负压的监护病房（ICU），以及大容量高压氧舱等。可开展大型、复杂手术及介入治疗，微创技术广泛并成熟应用于临床各个领域。

       医院拥有临床博士后流动站，有一级学科博士学位授权点2个、二级学科博士学位授权点25个；一级学科硕士学位授权点7个、二级学科硕士学位授权点54个；有博士研究生导师23名、硕士研究生导师147名；每年招收博、硕士研究生200余名；福建医科大学4个省级研究生教育创新基地挂靠我院。学院与美国、澳大利亚、德国、荷兰、加拿大、芬兰、新西兰、日本等国家以及港台等地区开展广泛的学术交流，与省内30多家市、县级医院建立友好协作关系。医院现有临床医学教研室（组）39个，临床教师700余名，每年承担着福建医科大学临床医学、医学影像学、医学检验学、口腔医学、麻醉学、药学、护理学、眼视光学、康复医学、临床医学病理学方向、临床医学急救学方向等10余个专业1000余名学生的临床教学与管理工作；医院作为我省首批住院医师规范化培训基地，涵盖17个专业，承担全省住院医师规范化培训工作，每年招收培训对象近200名。拥有近1000平方米临床医学培训中心，是美国心脏协会（AHA）授权的心血管急救培训中心，2013年成为全国大学生校外实践教学基地。配备无线智能模拟人Simman 3G、模拟仿真SIMoneTM分娩模型、多媒体心肺音听诊与腹触诊综合训练系统等国内外先进教学模具，承担多专业多层次临床技能培训及考核、继续医学教育学习班等工作，并按AHA标准开办BLS和ACLS培训班。在杰出教学团队的带领下，组织培训的临床医学实习生代表队，在第三届全国医学院校大学生临床技能竞赛中获华东区团体一等奖、全国总决赛团体二等奖；2014年“医学生临床综合能力培养体系的建立与实践”获省级教学成果特等奖。

       医院坚持科技兴院，成绩斐然。仅“十一五”以来，先后荣获国家科技进步二等奖、福建省科学技术奖等各级各类奖项74项；获得国家级自然基金、国家支撑计划课题等各级各类科研课题立项850多项。

       医院重视两个文明建设、加强职业道德教育、促进医疗质量、服务水平的不断提高。近年来，先后获得“全国卫生系统先进单位”、“全国医院管理年活动先进单位”、“抗震救灾先进集体”、“省继续教育先进单位”、“省卫生系统廉医廉政先进单位”、省卫生系统“双十佳单位”、省卫生系统“创文明行业满意窗口”示范单位、省级青年文明号、福建省五四青年奖章集体及中央宣传部、卫生部等10多个部委授予的“文化、科技、卫生三下乡”全国先进单位等40多个荣誉称号。此外，医院积极探索改革新模式，发挥大型公立医院在“医改”中的示范和带头作用，所采取的系列改革措施和创新的管理机制成为全国卫生系统关注的亮点，继荣获福建省唯一的全国“2011年度医院改革创新奖”后，再次蝉联全国“2012年度医院改革创新奖”。